寺伝では奈良時代、都を往来する人々や木津川流域に住する人々の災害を守る為に創建された寺院をもとに、万治年間(1658年頃)賢盛が開基し旧名蓮華山案養寺と言い、寛文10年(1670)無本寺から真言宗御室 仁和寺未となり貞享3年(1686)に法泉寺と改称しました。
明治初期には専教寺（薬師寺跡1487～1876)妙法寺を、明治40年には慶長年間(1596～1614)行盛が開基した地蔵院を合祀しました。